不完全显性是当两个等位基因中任何一个基因相对于另一个基因都不是显性时的一种情况。杂合子相对于亲本显性表现出一种中间显型时,可确认为这种情况。如果一株开红花的植株与一株开白花的植株杂交,那么后植株开的都是粉红色的,当粉红色后自交时,下一代开的花的颜色比率将是 1:2:1 。。 金鱼草花的颜色就是这种情况的一个例子。让真实遗传的红色品质和真实遗传的白色品质杂交, F1 是粉红色。 F1 自体受粉,得到的 F2 的比率为 1 (红) :2 (粉红) :1 (白)。假如是真正的混合色种,那么这种情况可能不会发生(真正的混合色种的下一代,不会表达为红色或白色性状;粉红色花之间的杂交应当只会产生粉红色花)。