甲公司是丁会计师事务所的常年审计客户，甲公司2014年财务报表继续委托丁会计师事务所进行审计。会计师事务所委派注册会计师对甲公司2014年6月30日与财务报告相关的内部控制的有效性实施审计。注册会计师的审计工作底稿中记载的有公司内部控制设计和运行的部分内容摘录如下：（1）为统一财务管理、提高会计核算水平，设置内部审计部，与财务部一并由财务总监分管。内部审计的主要职责是对公司内部控制的健全、有效，会计及相关信息的真实、合法、完整，资产的安全、完整，经营绩效以及经营合规性进行检查、监督和评价。（2）公司设置了业绩考评制度，财务总监每月审核实际销售收入（按产品细目）和销售费用（按产品细目），并与预算数和上年同期数比较，对于波动金额超过5%的项目进行分析并编制分析报告，销售经理审阅该报告并采取适当跟进措施。注册会计师抽查了最近3个月的分析报告，并看到上述管理人员在报告上签字确认，证明该控制已经得到执行。然而，注册会计师在一次与销售经理座谈中，发现销售经理对上月分析报告中销售费用上升8%并不知情。要求：（1）在测试和评价甲公司内部控制执行的有效性时，注册会计师通常应当实施哪些审计程序？（2）在测试控制运行的有效性时，注册会计师应当从哪些方面获取关于控制是否有效运行的审计证据？（3）请指出甲公司上述两项内部控制在设计与运行方面的缺陷，并简要说明理由。